RAID 6在增加了可靠性的同时，牺牲了部分随机写性能。在随机写操作中，在同样多的磁盘的RAID组中，RAID 6所花费的时间是RAID 5的的1.5倍。每次RAID 5 (7D + 1D)进行一次随机写操作，实际上产生了4个I/O:读老的应用数据，读老的校验数据，写新的应用数据和写新的校验数据(P)。而RAID 6做同样一个随机写操作，实际上需要6个I/O，读老的用户数据，读老的校验数据P，读老的校验数据Q，写新的用户数据，写新的校验数据P，写新的校验数据Q。这样就造成了RAID 5 (7D + 1D)和RAID 6 (6D + 2D)随机写的33%性能差异。