有轻功:用3行代码让Python数据处理脚本获得4倍提速

发表于:2018-7-27 16:42

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 作者:佚名    来源:集智专栏

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Python
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python
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  Python是一门非常适合处理数据和自动化完成重复性工作的编程语言,我们在用数据训练机器学习模型之前,通常都需要对数据进行预处理,而Python就非常适合完成这项工作,比如需要重新调整几十万张图像的尺寸,用Python没问题!你几乎总是能找到一款可以轻松完成数据处理工作的Python库。
  然而,虽然Python易于学习,使用方便,但它并非运行速度最快的语言。默认情况下,Python程序使用一个CPU以单个进程运行。不过如果你是在最近几年配置的电脑,通常都是四核处理器,也就是有4个CPU。这就意味着在你苦苦等待Python脚本完成数据处理工作时,你的电脑其实有75%甚至更多的计算资源就在那闲着没事干!
   
  今天我就教大家怎样通过并行运行Python函数,充分利用你的电脑的全部处理能力。得益于Python的 concurrent.futures 模块,我们只需3行代码,就能将一个普通数据处理脚本变为能并行处理数据的脚本,提速4倍。
  普通Python处理数据方法
  比方说,我们有一个全是图像数据的文件夹,想用Python为每张图像创建缩略图。
  下面是一个短暂的脚本,用Python的内置glob函数获取文件夹中所有JPEG图像的列表,然后用Pillow图像处理库为每张图像保存大小为128像素的缩略图:
  import glob
  import os
  from PIL import Image
  def make_image_thumbnail(filename):
  # 缩略图会被命名为"<original_filename>_thumbnail.jpg"
  base_filename, file_extension = os.path.splitext(filename)
  thumbnail_filename = f"{base_filename}_thumbnail{file_extension}"
  # 创建和保存缩略图
  image = Image.open(filename)
  image.thumbnail(size=(128, 128))
  image.save(thumbnail_filename, "JPEG")
  return thumbnail_filename
  # 循环文件夹中所有JPEG图像,为每张图像创建缩略图
  for image_file in glob.glob("*.jpg"):
  thumbnail_file = make_image_thumbnail(image_file)
  print(f"A thumbnail for {image_file} was saved as {thumbnail_file}")
  这段脚本沿用了一个简单的模式,你会在数据处理脚本中经常见到这种方法:
  首先获得你想处理的文件(或其它数据)的列表
  写一个辅助函数,能够处理上述文件的单个数据
  使用for循环调用辅助函数,处理每一个单个数据,一次一个。
  咱们用一个包含1000张JPEG图像的文件夹测试一下这段脚本,看看运行完要花多长时间:
  $ time python3 thumbnails_1.py
  A thumbnail for 1430028941_4db9dedd10.jpg was saved as 1430028941_4db9dedd10_thumbnail.jpg
  [... about 1000 more lines of output ...]
  real 0m8.956s
  user 0m7.086s
  sys 0m0.743s
  运行程序花了8.9秒,但是电脑的真实工作强度怎样呢?
  我们再运行一遍程序,看看程序运行时的活动监视器情况:
   
  电脑有75%的处理资源处于闲置状态!这是什么情况?
  这个问题的原因就是我的电脑有4个CPU,但Python只使用了一个。所以程序只是卯足了劲用其中一个CPU,另外3个却无所事事。因此我需要一种方法能将工作量分成4个我能并行处理的单独部分。幸运的是,Python中有个方法很容易能让我们做到!
  试试创建多进程
  下面是一种可以让我们并行处理数据的方法:
  1.将JPEG文件划分为4小块。 2.运行Python解释器的4个单独实例。 3.让每个Python实例处理这4块数据中的一块。 4.将这4部分的处理结果合并,获得结果的最终列表。
  4个Python拷贝程序在4个单独的CPU上运行,处理的工作量应该能比一个CPU大约高出4倍,对吧?
  最妙的是,Python已经替我们做完了最麻烦的那部分工作。我们只需告诉它想运行哪个函数以及使用多少实例就行了,剩下的工作它会完成。整个过程我们只需要改动3行代码。
  首先,我们需要导入concurrent.futures库,这个库就内置在Python中:
  import concurrent.futures
  接着,我们需要告诉Python启动4个额外的Python实例。我们通过让Python创建一个Process Pool来完成这一步:
  with concurrent.futures.ProcessPoolExecutor() as executor:
  默认情况下,它会为你电脑上的每个CPU创建一个Python进程,所以如果你有4个CPU,就会启动4个Python进程。
  最后一步是让创建的Process Pool用这4个进程在数据列表上执行我们的辅助函数。完成这一步,我们要将已有的for循环:
  for image_file in glob.glob("*.jpg"):
  thumbnail_file = make_image_thumbnail(image_file)
  替换为新的调用executor.map():
  image_files = glob.glob("*.jpg")
  for image_file, thumbnail_file in zip(image_files, executor.map(make_image_thumbnail, image_files)):
  该executor.map()函数调用时需要输入辅助函数和待处理的数据列表。这个函数能帮我完成所有麻烦的工作,包括将列表分为多个子列表、将子列表发送到每个子进程、运行子进程以及合并结果等。干得漂亮!
  这也能为我们返回每个函数调用的结果。Executor.map()函数会按照和输入数据相同的顺序返回结果。所以我用了Python的zip()函数作为捷径,一步获取原始文件名和每一步中的匹配结果。
  这里是经过这三步改动后的程序代码:
  import glob
  import os
  from PIL import Image
  import concurrent.futures
  def make_image_thumbnail(filename):
  # 缩略图会被命名为 "<original_filename>_thumbnail.jpg"
  base_filename, file_extension = os.path.splitext(filename)
  thumbnail_filename = f"{base_filename}_thumbnail{file_extension}"
  # 创建和保存缩略图
  image = Image.open(filename)
  image.thumbnail(size=(128, 128))
  image.save(thumbnail_filename, "JPEG")
  return thumbnail_filename
  # 创建Process Pool,默认为电脑的每个CPU创建一个
  with concurrent.futures.ProcessPoolExecutor() as executor:
  # 获取需要处理的文件列表
  image_files = glob.glob("*.jpg")
  # 处理文件列表,但通过Process Pool划分工作,使用全部CPU!
  for image_file, thumbnail_file in zip(image_files, executor.map(make_image_thumbnail, image_files)):
  print(f"A thumbnail for {image_file} was saved as {thumbnail_file}")
  我们来运行一下这段脚本,看看它是否以更快的速度完成数据处理:
  $ time python3 thumbnails_2.py
  A thumbnail for 1430028941_4db9dedd10.jpg was saved as 1430028941_4db9dedd10_thumbnail.jpg
  [... about 1000 more lines of output ...]
  real 0m2.274s
  user 0m8.959s
  sys 0m0.951s
  脚本在2.2秒就处理完了数据!比原来的版本提速4倍!之所以能更快的处理数据,是因为我们使用了4个CPU而不是1个。
  但是如果你仔细看看,会发现“用户”时间几乎为9秒。那为何程序处理时间为2.2秒,但不知怎么搞得运行时间还是9秒?这似乎不太可能啊?
  这是因为“用户”时间是所有CPU时间的总和,我们最终完成工作的CPU时间总和一样,都是9秒,但我们使用4个CPU完成的,实际处理数据时间只有2.2秒!
  注意:启用更多Python进程以及给子进程分配数据都会占用时间,因此靠这个方法并不能保证总是能大幅提高速度。如果你要处理非常大的数据集,这里有篇设置将数据集切分成多少小块的 文章 ,可以读读,会对你帮助甚大.
  这种方法总能帮我的数据处理脚本提速吗?
  如果你有一列数据,并且每个数据都能单独处理时,使用我们这里所说的Process Pools是一个提速的好方法。下面是一些适合使用并行处理的例子:
  从一系列单独的网页服务器日志里抓取统计数据。
  从一堆XML,CSV和JSON文件中解析数据。
  对大量图片数据做预处理,建立机器学习数据集。
  但也要记住,Process Pools并不是万能的。使用Process Pool需要在独立的Python处理进程之间来回传递数据。如果你要处理的数据不能在处理过程中被有效地传递,这种方法就行不通了。简而言之,你处理的数据必须是Python知道怎么应对的类型。
  同时,也无法按照一个预想的顺序处理数据。如果你需要前一步的处理结果来进行下一步,这种方法也行不通。
  那GIL的问题呢?
  你可能知道Python有个叫全局解释器锁(Global Interpreter Lock)的东西,即GIL。这意味着即使你的程序是多线程的,每个线程也只能执行一个Python指令。GIL确保任何时候都只有一个Python线程执行。换句话说,多线程的Python代码并不能真正地并行运行,从而无法充分利用多核CPU。
  但是Process Pool能解决这个问题!因为我们是运行单独的Python实例,每个实例都有自己的GIL。这样我们获得是真正能并行处理的Python代码!
  不要害怕并行处理!
  有了concurrent.futures库,Python就能让你简简单单地修改一下脚本后,立刻让你电脑上所有CPU投入到工作中。不要害怕尝试这种方法,一旦你掌握了,它就跟一个for循环一样简单,却能让你的数据处理脚本快到飞起。

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